MikroRNA-d (miRNA-d) on kiired (20–24 nt) mittekodeerivad RNA-d, mis on seotud geeniekspressiooni transkriptsioonijärgse reguleerimisega mitmerakulistes organismides, mõjutades igaühte mRNA-de usaldusväärsust ja translatsiooni. miRNA-sid transkribeerib RNA polümeraas II osana piiratud ja polüadenüleeritud põhitranskriptidest (pri-miRNA-d), mis võivad olla nii valku kodeerivad kui ka mittekodeerivad. Esimese transkripti lõhustab Drosha ribonukleaas III ensüüm, et saada ligikaudu 70-ndalase tüveahela prekursor miRNA (pre-miRNA), mida tsütoplasmaatiline Diceri ribonukleaas täiendavalt lõhustab, et genereerida küps miRNA ja antisenss miRNA täht (miRNA*) ) kaup. Küps miRNA on integreeritud otse RNA-indutseeritud summutuskompleksi (RISC), mis tunnistab eesmärgi mRNA -sid miRNA -ga ebatäiusliku aluse sidumise abil ja lõpeb enamasti eesmärgi mRNA translatsiooni pärssimise või destabiliseerimisega. RefSeq tähistab eeldatavat mikroRNA tüveahelat.
abm hsa mir
Kokkuvõte
Viimase kümnendi jooksul on saavutatud olulisi edusamme, mõistes enamiku kolorektaalsete vähkide (CRC) patogeneetilisi mehhanisme. Enamik vähktõve tüvirakke (CSC) on saanud palju tähelepanu ja arvatakse, et neil on koos CRC -ga oluline roll erinevate vähivormide patogeneesis. Käesolevas uuringus kinnitasime 4 CSC, L1TD1 , SLITRK6 , ST6GALNAC1 ja TCEA3 -ga seotud geeni ekspressiooni , tunnustatud varasemas bioinformaatika hindamises. Kasutades bioinformaatikat, on esikohale seatud potentsiaalsed miRNA-sihtgeeni korrelatsioonid. Kokku on kaasatud 70 formaliiniga fikseeritud parafiini sisaldavat biopsiaproovi 47 adenoomiga, varase kartsinoomiga adenoomi ja CRC-ga, kellel on metastaasid väljas ja lümfisõlmed.
Valitud geenide ja mikroRNA -de (miRNA -de) ekspressiooni hinnati kvantitatiivse PCR abil. Kõigi uuritud geenide ja nelja kuuest eelistatud miRNA-st ( hsa-miR-199a-3p , hsa-miR-335-5p , hsa-miR-425-5p , hsa-miR-1225-3p , hsa-miR-1233) erinev ekspressioon -3p ja hsa-miR-1303 ) esines vähemalt ühes CRC kantserogeneesi rühmas. L1TD1 , SLITRK6 , miR-1233-3p ja miR-1225-3p on korrelatsioonis pahaloomulisuse ulatusega. Kahjulik korrelatsioon miR-199a-3p ja selle ennustatud eesmärgi SLITRK6 vahel märgati, näidates potentsiaali täiendavaks eksperimentaalseks valideerimiseks CRC -s. Meie tulemused on täiendav tõend selle kohta, et CSC-ga seotud geenid ja nende regulatiivsed miRNA-d on seotud CRC parandamise ja arendamisega ning soovitavad, et mõned neist, märkimisväärselt miR-199a-3p ja selle SLITRK6 sihtgeen, on paljutõotavad CRC täiendavaks valideerimiseks.
